Программы в белых халатах
Человечество пережило множество эпидемий. Чума в Средние века буквально выкосила половину Европы. Последствия нашествия оспы можно сравнить с большой войной и нет никаких гарантий, что она не стала бы последним эпизодом в истории нашей цивилизации, не случись открытия Пастера. Даже в ХХ веке, когда медицина достигла значительного прогресса, «испанка» смогла унести миллионы жизней.
Коронавирус – тоже не подарок. Но отличие пандемии, которую мы переживаем сейчас, состоит в том, что уже через несколько месяцев ученые смогли разработать и выпустить сразу несколько вакцин, позволяющих бороться с распространением COVID-19. Сколько жизней они спасли потом подсчитают эпидемиологи и демографы. А мы пока можем только радоваться тому, что наука и технологии ускорили борьбу с напастями.
PerkinElmer
PerkinElmer – старая, основанная еще в 1937 году компания. Ее специализация – исследования в области биологии и медицины, диагностические системы, лабораторное и научное оборудование.
Прославилась PerkinElmer благодаря военным заказам: компания производила оптические устройства и дальномеры для американской армии еще в годы Второй мировой войны, а начиная с 60-х годов стала еще и одним из поставщиков NASA. Кстати, на счету PerkinElmer – компоненты для космических телескопов (компания, к примеру, создала главное зеркало телескопа «Хаббл»), а также датчик СО2, который в буквальном смысле спас жизнь экипажу во время аварии знаменитого «Аполлон 13».
Не чужда была PerkinElmer и экспериментов в области вычислительной техники. В 1973 году компания приобрела Interdata, одного из американских производителей серверов, и на его базе создала Perkin-Elmer's Data Systems Group. Выпускала она 32-разрядные системы, очень похожие на мейнфреймы IBM System/370, зато – с оригинальной операционной системой на базе Unix.
Просто так эксперименты с компьютерами не заканчиваются – это навсегда. И PerkinElmer тоже не смогла избавиться от такой «вредной привычки». Какие исследования в области Life Sciences могут сегодня обойтись без программных решений? И в 2011 году компания пополнила свой портфель активов, купив CambridgeSoft, производителя популярного пакета ПО для химиков, биологов, фармацевтов и клинических исследователей.
Выбор в пользу CambridgeSoft был не случаен. Ее пакет ChemOffice к тому времени был едва ли не самым популярным среди всех профессиональных решений для специалистов в области химии, биологии и смежных областей. CambridgeSoft даже можно сравнить с Microsoft: ее решения можно любить или ненавидеть, но игнорировать – просто невозможно. ChemOffice в химии и биологии – примерно то же самое, что в Matchcad или Maple в математике.
Что умеет ChemOffice
Сфера применения ChemOffice – прорисовка химических уравнений и реакций, Формул органических веществ, как бы сложны они не были, воспроизведение молекулярной структуры в трехмерной графике, анализ физико-химических параметров разных веществ, поиск в профессиональных базах данных. Иными словами, это – базовый инструмент, без которого сегодня не могут обойтись химические или биологические исследования.
Важнейший элемент ChemOffice – редактор ChemDraw. Именно в нем и ведется «конструирование» веществ, от простейших оксидов до сложнейших молекул ДНК. Он позволяет разложить вещество на элементы, соединить их, а ChemDraw уже самостоятельно найдет для них оптимальные сочетания.
Более того, в решении имеется и встроенный «спелл-чекер»: оно проверить правильность результата и продемонстрирует исследователю найденные ошибки. При этом тратить время химикам и биологам на несвойственное для них рисование не придется – первоначальный набор кирпичиков можно за несколько кликов получить из обширной библиотеки шаблонов.
«Автоматизированы» в ChemDraw даже химические реакции. Решению достаточно указать проблемное место, в котором рвется связь между компонентами, и оно само «пропишет» в нем необходимую для соединения химическую реакцию, и при этом в составленном уравнении учтет продукты распада с их молекулярной массой. Можно будет даже визуализировать порядок операций в лаборатории или на производстве – для этого имеется богатый набор клипартов.
Очень важный элемент работы с ChemDraw – дополнения (собственно говоря, они-то и делают ChemOffice «офисом»).
ChemDraw прорисовывает химические соединения и процессы на плоскости. Но в химико-биологических исследованиях особенно важна объемная картинка. Ее можно создать при помощи Chem3D. Это решение анализирует молекулярные связи, характеристики атомов различных веществ и формирует объемную структуру соединения, даже такого, которое до сих пор было неизвестно или малоизучено.
Мгновенно проводить «в уме» лабораторные исследования и самостоятельно изучать физическую структуру вещества Chem 3D, конечно, не умеет. Но оказать исследователям помощь и визуализировать результаты их работы сможет.
Еще один компонент ChemOffice предназначен уже не для работы, а для управления результатами исследований. Для того, чтобы упорядочить результаты исследований и управлять базой разработок имеется ChemFinder. При помощи этой утилиты можно не только вести поиск в файлах, созданных в ChemDraw (форматы файлов программ-аналогов, кстати, тоже поддерживаются). Она отвечает и за экспорт данных из ChemDraw в базы данных.